Hinrunden-tabelle der 3. Liga 2008/2009
| Pl. | Mannschaft | Sp. | Tore | Diff. | Pkt | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Paderborn | 19 | 38:21 | 17 | 41 | |
| 2 | Union Berlin | 19 | 33:15 | 18 | 39 | |
| 3 | K. Emden | 19 | 24:17 | 7 | 35 | |
| 4 | Düsseldorf | 19 | 28:16 | 12 | 33 | |
| 5 | Unterhaching | 19 | 26:26 | 0 | 32 | |
| 6 | RW Erfurt | 19 | 27:20 | 7 | 30 | |
| 7 | Offenbach | 19 | 25:18 | 7 | 29 | |
| 8 | FC Bayern II | 19 | 24:20 | 4 | 29 | |
| 9 | Stuttgart II | 19 | 35:24 | 11 | 27 | |
| 10 | Sandhausen | 19 | 29:28 | 1 | 24 | |
| 11 | FC Carl Zeiss | 19 | 24:28 | -4 | 24 | |
| 12 | Braunschweig | 19 | 23:23 | 0 | 23 | |
| 13 | Aue | 19 | 24:28 | -4 | 23 | |
| 14 | Aalen | 19 | 17:24 | -7 | 22 | |
| 15 | Dresden | 19 | 16:22 | -6 | 20 | |
| 16 | Regensburg | 19 | 19:30 | -11 | 19 | |
| 17 | Burghausen | 19 | 24:38 | -14 | 19 | |
| 18 | Wuppertal | 19 | 18:28 | -10 | 18 | |
| 19 | Bremen II | 19 | 25:35 | -10 | 13 | |
| 20 | St. Kickers | 19 | 24:42 | -18 | 13 |
Die Mannschaften auf den Plätzen 18 bis 20 steigen in die Regionalliga ab
Die Mannschaft auf Platz 3 kommt in die Relegation zur 2. Bundesliga
Stuttgarter Kickers: 3 Punkte Abzug: wegen Liquiditätsproblemen
Kickers Emden: Lizenzantrag zurückgezogen
Punkteabzüge werden nur in der Gesamttabelle berücksichtigt.
Die letzten beiden Male, als die Bayern Meister wurden, konnten sie ja nichts dafür.
— Klaus Augenthaler